Акихабара — район, где встречаются самые необычные персонажи. Одни чудаковаты, другие и вовсе кажутся не от мира сего. Над магазинчиком старых телевизоров как раз обосновалась группа таких людей, именующая себя Лабораторией проблем времени. Во главе — восемнадцатилетний Ринтаро Окабэ, самопровозглашённый гений, одержимый идеей раскрытия мирового заговора. Без хакера в серьёзных делах никуда, и он есть — Итару Хасида, упитанный парень, помешанный на аниме и играх. Маюри Сиина, давняя подруга Ринтаро, работает в мейд-кафе и обожает перевоплощаться в разных персонажей, добавляя лаборатории немного тепла и света. А вот научную сторону неожиданно усилила Курису Макисэ, юная и блестящая умом, искавшая и умственных вызовов, и простого человеческого общения.
Всей этой командой они умудрились собрать нечто вроде машины времени — из старой микроволновки и того, что нашлось на распродажах. Иногда великие прорывы совершают именно энтузиасты, а не солидные институты. Но то, что началось потом, заставило бы даже знаменитый парадокс о путешествии в прошлое показаться невинной загадкой. Главный герой вскоре пожалел, что вообще запустил этот эксперимент, названный "Врата Штейна". Он бы рискнул собой, но не другими. Как говорится, что сделано, то сделано. Или… нет ли способа всё исправить?